מי שמגיעים לבנק הזרע לרכוש זרע, במיוחד כזה שמגיע מבנקי זרע בחו"ל נשאלים לעתים האם ירצו לרכוש זרע תורם לשימוש בהזרעה תוך צווארית (Intra Cervical Insemination או (ICI או זרע תורם לשימוש בהזרעה תוך רחמית (Intra Uterine Insemination או IUI). ההבדל בין שני סוגי הזרע האלה טמון בהכנה ובשיטת ההזרעה.
זרע תורם להזרעה תוך צווארית (ICI) הוא זרע גולמי או לא שטוף. הוא כולל פלזמת זרע, שהיא החלק הנוזלי של הזרע, יחד עם תאי הזרע. סוג זה של זרע בדרך כלל מכיל יותר זירעונים במנה ואף זול יותר מזרע להזרעה תוך רחמית (IUI) מכיוון שהוא לא עבר השבחה.
זרע להזרעה תוך צווארית משמש בדרך כלל להזרעה בסמוך לצוואר הרחם, שבה הזרע מושם ישירות באזור צוואר הרחם. היתרון בזרע זה הוא שניתן להשתמש בו גם להזרעה עצמית בבית לאזור צוואר הרחם, ללא עזרת רופא. שיטה זו מחקה בצורה קרובה יותר את ההפריה הטבעית מכיוון שהיא אינה כוללת השמה ישירה של הזרע לתוך חלל הרחם.
זרע תורם להזרעה תוך רחמית (IUI) הוא זרע שטוף, שעבר השבחה על מנת להסיר את פלזמת הזרע ולהשאיר רק תאי זרע מרוכזים ונעים. תהליך השטיפה מסיר חלבונים, פרוסטגלנדינים ורכיבים אחרים שיכולים לגרום לתגובות לא נעימות אם יושמו ישירות לתוך חלל הרחם.
זרע להזרעה תוך רחמית מוכן במיוחד להזרעה תוך רחמית (IUI), שבה הזרע השטוף מוכנס לרחם באמצעות צנתר דק, בעד תעלת צוואר הרחם ישירות לתוך חלל הרחם וכך עוקף את צוואר הרחם לחלוטין. סוג זה של זרע בדרך כלל משמש להזרעה על ידי רופא.ה במרפאה. שיטה זו מביאה את הזרע קרוב יותר לפתח החצוצרות, מה שמגדיל את הסיכויים שהזרע האיכותי ביותר יפגוש את הביצית ובכך מגביר מאד את הסיכוי להפריה.
הזרעה תוך צווארית יכולה להתבצע בבית, מה שמספק יותר נוחות ופרטיות, בעוד שהזרעה תוך רחמית דורשת מרפאה ורופא מומחה. הזרעה תוך רחמית כוללת הליך פולשני יותר ועלולה להיות כרוכה בסיכונים מעט גבוהים יותר לזיהום או אי נוחות בהשוואה להזרעה תוך צווארית. הזרעה תוך רחמית נחשבת לרוב ליעילה הרבה יותר מהזרעה תוך צווארית, במיוחד במקרים של אי פוריות לא מוסברת או אי פוריות הגבר, מכיוון שהיא משימה ריכוז גבוה יותר של תאי זרע נעים קרוב יותר לביצית.
לטיפולי הפריה (IVF) מתאים יותר זרע תורם לשימוש בהזרעה תוך רחמית (IUI)מאחר שהוא כבר מגיע שטוף ומרוכז. עם זאת, ניתן גם להשתמש בזרע שנועד להזרעה תוך צווארית (ICI), אך הדבר מחייב ביצוע שטיפה והשבחה לפני ביצוע ההפריה התוך רחמית. פעולת שטיפת הזרע גורמת לעתים לירידה בכמות הזרעים בתנועה למנה, אך נדיר שהדבר יפריע להצלחת תהליך ההפריה החוץ גופית.
הבחירה בין זרע להזרעה תוך צווארית לבין זרע להזרעה תוך רחמית תלויה בגורמים שונים, בעיקר רצון לבצע הזרעה עצמית. בישראל, היכן שהעלות של ביצוע הזרעה תוך רחמית (IUI) לא גבוהה ביחס לעלות הגבוהה יחסית של מנת זרע תורם, מקובל פחות לבצע הזרעות עצמיות, לאור שעורי ההצלחה הגבוהים יותר בהזרעה תוך רחמית.